能进行有性生殖，草履虫的有性生殖与多细胞动物(甚至高等动物)的有性生殖本质上相似，即都是通过受精作用实现基因的重新组合，再经发育，建成下一代新个体的过程。
草履虫受精后核胚基和皮层胞器的发育相当于多细胞动物的胚胎发育，不同的是多细胞动物受精后发育成体细胞与种细胞合一的动物体，而草履虫受精后发育成体核与种核合一的新的单细胞。
正因草履虫是单细胞，它的受精和受精后发育都只能在亲体的细胞领地上进行，或者说，草履虫的有性生殖只能是在亲体的细胞上建造子体细胞，也就是说，草履虫是以亲体的死亡换取子体的新生，因此它没有像多细胞动物那样亲子两代可以并存的现象。
正由于草履虫的两代细胞在同一细胞领地上更替，才使得一些模糊概念得以产生，一是“草履虫可以通过接合返老还童”。“返老还童”通常是指同一个个体由于某种外在因素的作用，由原来已老化转变为年青化。事实上接合生殖起的不是返老还童作用，而是“老死童生”的作用。
另一错误概念是“草履虫可以不死”。事实上草履虫的无性系迟早必死，即使得到接合生殖机会或发生自配，表面上看似乎虫体是延续未死，实质上代表亲体的老大核和老胞器已死，有性过程之后的草履虫已是新生儿。
只有小核是不死的，但它也必须经过减数分裂和二倍基因组的重新组合，再经胚核的重新发育才能成为不死的小核。
草履虫是有性生殖还是无性生殖 扩展
草履虫既有性生殖也有无性生殖 。
草履虫的生殖方式是无性生殖和有性生殖。草履虫无性生殖就是横二分裂，横二分裂是指无性繁殖中单细胞沿着横轴分裂繁殖的方式。一般是小核先进行有丝分裂，大核再进行无丝分裂，然后虫体中部横溢，分成2个新个体。有性生殖就是接合生殖，2个草履虫的口沟和口沟粘合在一起，粘合处的细胞膜溶解，两个虫体的细胞质相通，小核离开大核。有性生殖分裂2次会形成4个核，其中3个解体，大核会逐渐消失。
